En el área de mejoramiento genético del trigo se han liberado más de 60 variedades mejoradas, en un trabajo colaborativo entre el CIANO-INIFAP y el Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT). Esto ha permitido incrementar los rendimientos unitarios regionales de 2.8 toneladas por hectárea en 1963 hasta más de 6.0 toneladas por hectárea en el año 2010; es decir, un incremento en los rendimientos unitarios de 85 kilogramos por año en promedio. Asimismo, ha sido posible disminuir al mínimo los riesgos potenciales de epifitias de royas tanto de la hoja como del tallo y la roya lineal de reciente aparición en el sur de Sonora. Lo anterior ha asegurado la sostenibilidad de la producción de trigo a través de los años. Por otro lado, también ha sido posible contar con variedades de trigo que poseen un potencial de rendimiento superior a las 8.0 toneladas por hectárea.
Se ha logrado liberar alrededor de 40 variedades de otros cultivos como soya, maíz, algodonero, ajonjolí, cártamo y garbanzo.
En trigo se desarrolló el sistema de producción en surcos el cual incremento la eficiencia en el uso del agua y de los insumos y redujo los costos de producción hasta en un 25%; dicho sistema se utiliza en mas de 150,000 ha en los estados de Sonora y Sinaloa.
La investigación apoyada por el Patronato ha permitido definir sistemas sostenibles de producción para varios otros cultivos como algodonero, cártamo, soya, ajonjolí, sorgo, maíz, frijol, hortalizas, y frutales perenifolios y caducifolios, en especial la vid y los cítricos.
Además, se han generado tecnologías para el uso racional de agroquímicos y la disminucion de riesgos por la presencia de plagas, enfermedades y maleza, tendientes a lograr sistemas sostenibles de produccion que no dañan al medio ambiente.